История Лицея началась с 1966 г., тогда он носил название "Средняя общеобразовательная школа №3".
В 2008 году, в связи с тем, что дети занимались в профильных физико-математических классах, было решено присвоить средней общеобразовательной школе №3 статус лицея. С 2019 и по настоящее время Лицеем руководит Гордеева Екатерина Зиновьевна.
С момента создания школы и до сегодняшнего дня Лицей не стоит на месте, а развивается с каждым днем. В этом большая заслуга всего коллектива и, конечно же, обучающихся.